| 鳥綱 Class AVES | ||
| アビ目 Order GAVIIFORMES | ||
| アビ科 Family Gaviidae | ||
| No.1 | シロエリオオハム | Gavia pacifica (Lawrence,1858) |
| ミズナギドリ目 Order PROCELLARIIFORMES | ||
| ミズナギドリ科 Family Procellariidae | ||
| No.2 | オオミズナギドリ | Calonectris leucomelas (Temminck,1835) |
| コウノトリ目 Order CICONIIFORMES | ||
| トキ科 Family Threskiornithidae | ||
| No.3 | トキ | Nipponia nippon (Temminck,1835) |
| カモ目 Order ANSERIFORMES | ||
| カモ科 Family Anatidae | ||
| No.4 | マガン（マガン） | Anser albifrons frontalis Baird,1858 |
| No.5 | オシドリ | Aix galericulata (Linnaeus,1758) |
| タカ目 Order FALCONIFORMES | ||
| タカ科 Family Accipitridae | ||
| No.6 | トビ | Milvus migrans Boddaert,1783 |
| No.116 | オオワシ | Haliaeetus pelagicus (Pallas,1811) |
| No.7 | ハイタカ | Accipiter nisus (Linnaeus,1758) |
| No.8 | ノスリ | Buteo buteo (Linnaeus,1758) |
| ハヤブサ科 Family Falconidae | ||
| No.9 | コチョウゲンボウ | Falco columbarius Linnaeus,1758 |
| キジ目 Order GALLIFORMES | ||
| ライチョウ科 Family Tetraonidae | ||
| No.10 | エゾライチョウ | Tetrastes bonasia (Linnaeus,1758) |
| 注：農学部鳥類標本群には1990年の調査の際にライチョウ１体も確認されていたが、 1993〜1994年頃に空中分解してしまったため処分されたと伝えられる。 |
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| キジ科 Family Phasianidae | ||
| No.11 | ウズラ | Coturnix coturnix (Linnaeus,1758) |
| No.12 | ヤマドリ | Phasianus soemmerringii Temminck, 1830 |
| No.13 | キジ（コウライキジ） | Phasianus colchicus karpowi Buturlin,1904 |
| No.14 | キジ | Phasianus colchicus Kuroda,1919 |
| ツル目 Order GRUIFORMES | ||
| クイナ科 Family Rallidae | ||
| No.15 | クイナ | Rallus aquaticus Linnaeus,1758 |
| No.16 | バン | Gallinula chloropus (Linnaeus,1758) |
| チドリ目 Order CHARADRIIFORMES | ||
| タマシギ科 Family Rostratulidae | ||
| No.17 | タマシギ | Rostratula benghalensis (Linnaeus,1758) |
| シギ科 Family Scolopacidae | ||
| No.18 | ヤマシギ | Scolopax rusticola Linnaeus,1758 |
| No.19 | タシギ | Gallinago gallinago (Linnaeus,1758) |
| No.20 | タシギ | Gallinago gallinago (Linnaeus,1758) |
| No.21 | アオシギ | Gallinago solitaria Hodgson,1831 |
| カモメ科 Family Laridae | ||
| No.22 | ユリカモメ | Larus ridibundus Linnaeus,1766 |
| No.23 | ユリカモメ | Larus ridibundus Linnaeus,1766 |
| No.24 | コアジサシ | Sterna albifrons Pallas,1764 |
| ウミスズメ科 Family Alcidae | ||
| No.25 | ウミスズメ | Synthliboramphus antiquus (Gmelin,1789) |
| No.26 | ウトウ | Cerorhinca monocerata (Pallas,1811) |
| ハト目 Order COLUMBIFORMES | ||
| ハト科 Family Columbidae | ||
| No.27 | ドバト | Columba livia Linnaeus,1758 |
| No.28 | カラスバト(アカガシラカラスバト) | Columba janthina nitens (Stejneger,1887) |
| No.29 | シラコバト | Streptopelia decaocto (Freivaldszky,1838) |
| No.30 | アオバト | Sphenurus sieboldii (Temminck,1835) |
| カッコウ目 Order CUCULIFORMES | ||
| カッコウ科 Family Cuculidae | ||
| No.31 | ジュウイチ | Cuculus fugax Horsfield,1821 |
| No.32 | カッコウ | Cuculus canorus Linnaeus,1758 |
| No.33 | ツツドリ | Cuculus saturatus Bryth,1843 |
| No.34 | ホトトギス | Cuculus poliocephalus Latham,1790 |
| フクロウ目 Order STRIGIFORMES | ||
| フクロウ科 Family Strigidae | ||
| No.35 | コミミズク | Asio flammeus (Pontoppidan,1763) |
| No.36 | コミミズク | Asio flammeus (Pontoppidan,1763) |
| No.37 | フクロウ | Strix uralensis Pallas,1771 |
| アマツバメ目 Order APODIFORMES | ||
| アマツバメ科 Family Apodidae | ||
| No.38 | ハリオアマツバメ | Chaetura caudacuta (Latham,1801) |
| No.39 | アマツバメ | Apus pacificus (Latham,1801) |
| ブッポウソウ目 Order CORACIIFORMES | ||
| カワセミ科 Family Alcedinidae | ||
| No.40 | ヤマセミ | Ceryle lugubris (Temminck,1834) |
| No.41 | ヤマセミ | Ceryle lugubris (Temminck,1834) |
| No.42 | アカショウビン | Halcyon coromanda (Latham,1790) |
| キツツキ目 Order PICIFORMES | ||
| キツツキ科 Family Picidae | ||
| No.43 | アリスイ | Jynx torquilla Linnaeus,1758 |
| No.44 | アオゲラ | Picus awokera Temminck,1835 |
| No.45 | アオゲラ | Picus awokera Temminck,1835 |
| No.46 | キタタキ | Dryocopus javensis (Horsfield,1821) |
| No.47 | アカゲラ | Dendrocopos major (Linnaeus,1758) |
| No.48 | アカゲラ | Dendrocopos major (Linnaeus,1758) |
| No.49 | オオアカゲラ | Dendrocopos leucotos (Bechstein, 1803) |
| No.50 | コゲラ（コゲラ） | Dendrocopos kizuki seebohmi (Hargitt,1884) |
| スズメ目 Order PASSERIFORMES | ||
| ヒバリ科 Family Alaudidae | ||
| No.51 | ヒバリ（オオヒバリ） | Alauda arvensis pekinensis Swinhoe,1863 |
| No.52 | ヒバリ（ヒバリ） | Alauda arvensis japonica Temminck & Schlegel,1848 |
| ツバメ科 Family Hirundinidae | ||
| No.53 | イワツバメ | Delichon urbica (Linnaeus,1758) |
| セキレイ科 Family Motacillidae | ||
| No.54 | キセキレイ | Motacilla cinerea Tunstall, 1771 |
| No.55 | セグロセキレイ | Motacilla grandis Sharpe,1885 |
| No.56 | ビンズイ | Anthus hodgsoni Richmond,1907 |
| No.57 | タヒバリ | Anthus spinoletta (Linnaeus,1758) |
| No.58 | タヒバリ | Anthus spinoletta (Linnaeus,1758) |
| サンショウクイ科 Family Campephagidae | ||
| No.59 | サンショウクイ | Pericrocotus divaricatus (Raffles, 1822) |
| ヒヨドリ科 Family Pycnonotidae | ||
| No.60 | ヒヨドリ | Hypsipetes amaurotis (Temminck,1830) |
| No.61 | ヒヨドリ | Hypsipetes amaurotis (Temminck,1830) |
| モズ科 Family Laniidae | ||
| No.62 | チゴモズ | Lanius tigrinus Drapiez,1828 |
| No.63 | モズ | Lanius bucephalus Temminck & Schlegel,1847 |
| No.64 | アカモズ | Lanius cristatus Linnaeus, 1758 |
| レンジャク科 Family Bombycillidae | ||
| No.65 | ヒレンジャク | Bombycilla japonica (Siebold,1824) |
| カワガラス科 Family Cinclidae | ||
| No.66 | カワガラス | Cinclus pallasii Temminck,1820 |
| ミソサザイ科 Family Troglodytidae | ||
| No.67 | ミソサザイ | Troglodytes troglodytes (Linnaeus, 1758) |
| イワヒバリ科 Family Prunellidae | ||
| No.68 | カヤクグリ | Prunella rubida (Temminck & Schlegel,1848) |
| No.69 | カヤクグリ | Prunella rubida (Temminck & Schlegel,1848) |
| ツグミ科 Family Turdidae | ||
| No.70 | コマドリ（コマドリ） | Erithacus akahige akahige (Temminck,1835) |
| No.71 | アカヒゲ（アカヒゲ） | Erithacus komadori komadori (Temminck,1835) |
| No.72 | ノゴマ | Erithacus calliope (Pallas,1776) |
| No.73 | コルリ | Erithacus cyane (Pallas,1776) |
| No.74 | ルリビタキ | Tarsiger cyanurus (Pallas,1773) |
| No.75 | ジョウビタキ | Phoenicurus auroreus (Pallas,1776) |
| No.76 | ノビタキ | Saxicola torquata (Linnaeus,1766) |
| No.77 | イソヒヨドリ | Monticola solitarius (Linnaeus,1758) |
| No.79 | トラツグミ | Zoothera dauma (Latham, 1790) |
| No.78 | マミジロ | Turdus sibiricus Pallas,1776 |
| No.80 | アカハラ | Turdus chrysolaus Temminck,1831 |
| No.81 | ツグミ | Turdus naumanni Temminck, 1820 |
| ウグイス科 Family Sylviidae | ||
| No.82 | ウグイス | Cettia diphone (Kittlitz,1831) |
| No.83 | オオヨシキリ | Acrocephalus arundinaceus (Linnaeus,1758) |
| No.84 | メボソムシクイ | Phylloscopus borealis (Blasius, 1858) |
| No.85 | メボソムシクイ | Phylloscopus borealis (Blasius, 1858) |
| No.86 | キクイタダキ | Regulus regulus (Linnaeus,1758) |
| No.87 | セッカ | Cisticola juncidis (Rafinesque,1810) |
| ヒタキ科 Family Muscicapidae | ||
| No.88 | キビタキ | Ficedulaa narcissina Temminck,1835 |
| No.89 | ムギマキ | Ficedula mugimaki (Temminck,1835) |
| No.90 | ムギマキ | Ficedula mugimaki (Temminck,1835) |
| No.91 | オオルリ | Cyanoptila cyanomelana (Temminck,1829) |
| No.92 | サメビタキ | Muscicapa sibirica Gmelin,1789 |
| No.93 | コサメビタキ | Muscicapa latirostris Raffles,1822 |
| カササギヒタキ科 Family Monarchidae | ||
| No.94 | サンコウチョウ | Terpsiphone atrocaudata (Eyton, 1839) |
| No.95 | サンコウチョウ | Terpsiphone atrocaudata (Eyton, 1839) |
| エナガ科 Family Aegithalidae | ||
| No.96 | エナガ（シマエナガ） | Aegithalos caudatus japonicus Prazak,1897 |
| No.97 | エナガ（エナガ） | Aegithalos caudatus trivirgatus (Temminck & Schlegel,1848) |
| シジュウカラ科 Family Paridae | ||
| No.98 | コガラ | Parus montanus Baldenstein,1827 |
| No.99 | ヒガラ | Parus ater Linnaeus,1758 |
| No.100 | ヤマガラ | Parus varius Temminck & Schlegel, 1848 |
| ゴジュウカラ科 Family Sittidae | ||
| No.101 | ゴジュウカラ | Sitta europaea Linnaeus, 1758 |
| No.102 | キバシリ | Certhia familiaris Linnaeus,1758 |
| ミツスイ科 Meliphagidae | ||
| No.103 | メグロ | Apalopteron familiare (Kittlitz,1831) |
| ホオジロ科 Family Emberizidae | ||
| No.104 | ホオジロ | Emberiza cioides Brandt,1843 |
| No.105 | カシラダカ | Emberiza rustica Pallas,1776 |
| アトリ科 Family Fringillidae | ||
| No.106 | アトリ | Fringilla montifringilla Linnaeus,1758 |
| No.107 | ハギマシコ | Leucosticte arctoa (Pallas,1811) |
| No.108 | オオマシコ | Carpodacus roseus (Pallas,1776) |
| No.109 | ウソ（ウソ） | Pyrrhula pyrrhula griseiventris Lafresnaye,1841 |
| No.110 | ウソ（アカウソ） | Pyrrhula pyrrhula rosacea Seebohm,1882 |
| No.111 | シメ | Coccothraustes coccothraustes (Linnaeus,1758) |
| ムクドリ科 Family Sturnidae | ||
| No.112 | コムクドリ | Sturnus philippensis (Forster,1781) |
| No.113 | ムクドリ | Sturnus cineraceus Temminck,1835 |
| カラス科 Family Corvidae | ||
| No.114 | オナガ | Cyanopica cyana (Pallas,1776) |
| No.115 | カササギ | Pica pica (Linnaeus,1758) |
| （No.116） | （No.116はオオワシ） | |
| 不明綱 | ||
| 不明目 | ||
| 不明科 | ||
| No.117 | マハギ | |
| 爬虫綱 Class REPTILIA | ||
| カメ目 | ||
| 不明科 | ||
| No.118 | カメの一種 | |
| 哺乳綱 Class MAMMALIA | ||
| 翼手目 Order CHIROPTERA | ||
| 小翼手亜目 | ||
| 不明科 | ||
| No.119 | コウモリの一種 | |
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